Компьютерная модель помогла понять, как организм реагирует на жару

Прежде эксперименты in silico не позволяли добиться схожих результатов из-за несовершенства компьютерных моделей. Об этом сообщается в материале, размещенном в журнале Scientific Reports.

По утверждению Антона Чугунова из Института биохимии РАН в столице России, метод компьютерной симуляции позволил ученым увидеть, каким образом белок реагирует на температурные изменения и как они сказываются на особенностях его работы. Это ученые увидели, изучая компьютерную симуляцию работы белка. Белок TRPV1 участвует в системе поддержания постоянной температуры тела.

Как поведал Чугунов, ученые изучили молекулярную динамику для любого состояния при четырех температурах: две были выше и две ниже температуры активации рецептора, которая соответствует 43 градусам Цельсия. «Это настолько тонкий процесс, что мы были поражены открывшимся возможностям», — объясняет Антон Чугунов из Института биохимии РАН в российской столице. При повышении температуры этот ионный канал начинает пропускать ионы натрия, магния и кальция через клеточную мембрану, сообщая об изменении окружающих условий. Поэтому до реального момента процесс активации рецептора оставался не до конца ясным. Они просчитали молекулярную динамику при четырех различных температурах, начиная от 43 градусов.

Опубликованные данные демонстрируют, что нынешние вычислительные мощности помогают изучать ионные каналы и особенности их работы во временных интервалах, которые пока нереально регистрировать экспериментально.

Конечной целью работы можно считать создание в ближайшем будущем виртуального рецептора TRPV1, пригодного для предсказания структуры селективных лигандов (особых молекул, «обслуживающих» белки). Эти данные, как намереваются ученые из ИБХ РАН, помогут сделать не менее эффективные анальгетики, лишенные побочных эффектов применяемых сегодня препаратов.

Российские ученые разгадали тайну реакции организма на жару

Добавить комментарий

Ваш адрес email не будет опубликован.